This is an intermediate tutorial on a powerful molecular visualizer, PyMOL. We will go through only selected things to prepare high-resolution publication-quality images. Download and install one of ...

Pymolはタンパク質等の3D描画を行うソフトウェアです。Protein Data Bankが多数の結晶構造のpdbデータを提供しています。タンパク質構造だけでなく、自身で作成したpdbファイル、AutoDockのドッキングシミュレーションで使用するpdbqtファイル等の描画にも多用します ...

第1章 PyMOLチュートリアル: アルカリホスファターゼの構造を見る 酵素などのタンパク質は、それぞれ固有のアミノ酸配列をもち、それが固有の立体構造に折れたたまります。これにより、アミノ酸配列上では離れていた残基同士が接近し、それらが協同して ...